Genetika
Genetika je samostatný vedný odbor biológie, ktorý sa zaoberá dedičnosťou a premenlivosťou živých organizmov. Zakladateľom genetiky je Johan Gregor Mendel - bol to brnenský mních a veľkú časť svojho života trávil tým, že krížil rôzne organizmy. Robil experimenty hlavne s hrachom, no aj s včelami a podobne. U hrachu sledoval dedičnosť viacerých znakov: napríklad tvar semien, farbu semien, farbu kvetov, výšku rastliny a pod. Postupne sformoval isté Mendelove Zákony Kríženia. Ešte nepoznal pojem gén, ale hovoril o dedičných vlohoch.
Dedičnosť je vlastnosť živých organizmov, ktorá umožňuje výskyt totožných alebo podobných znakov u potomstva pri pohlavnom rozmnožovaní.
Premenlivosť, alebo inak varibilita je vlastnosť živých organizmov, ktorá umožňuje výskyt aj odlišných znakov potomstva. Umožňuje ju jednak vznik mutácií, crossing over, kombinácie chromozómov pri oplodnení, ale aj prostredie. Môže byť dedičná a nededičná. Dedičná je premenlivosť získaná gémni a nededičná sa zakladá na podmienkach.
Genetická informácia každého organizmu je zapísaná v nukleových kyselinách, resp. v jadre, či nukleoide. Zhruba v roku 1896 nukleové kyseliny objavil a izoloval F. Miescher. Štruktúru DNA potom objasnili J. Watson a F. Crick spolu s R. Franklinovou. 24.4.1953 vydali malý článok o štruktúre DNA a v 1962 dostali Watson, Criek a Wilkins Nobelovu cenu.
Základná stavebná jednotka sa nazýva NUKLEOTID. Poradie nukleotidov sa nazýva v nukleovej kyseline sa nazýva sekvencia. Nukleotidy sa označujú písmenami dusíkatej bázy v nukleotide.
GÉN je úsek molekuly DNA, ktorý nesie genetickú informáciu pre vytvorenie určitej črty organizmu. Gén je základná funkčná jednotka dedičnosti. Umiestnenie génu na molekule DNA sa nazýva Lokus. Konkrétna forma génu sa nazýva ALELA.
Eukaryotická diploidná bunka nesie dva páry homologických chromozómov. Každý gén v eukaryotickej diploidnej bunke je zastúpený jedným alelickým párom.
A
- dominantná alela a
- recesívna
alela
Aa
- dominantný homozygot - prejaví sa dom. alela
Aa
- heterozygot - prejaví sa dom. alela aa
-
recesívny homozygot - prejaví sa recesívna alela
Súbor všetkých génov v bunke je GENOTYP. Ak zarátame aj dočasné regulačné gény, volá sa to GENÓM.
Vonkajší prejav génu nazývame ZNAK. Súbor všetkých znakov nazývame FENOTYP.
Poznám znaky kvalitatívne a kvantitatívne. Kvalitatívne znaky podmieňuje buď jeden gén (monogénne), alebo malý počet génov silného účinku a teda vplyv prostredia je minimálny. Kvantitatívne znaky sú podmienené veľkým počtom génov malého účinku.
Prenos Genetickej Informácie Na Molekulovej Úrovni
Prenos genetickej informácie na molekulovej úrovni pozostáva z troch procesov, ktoré predložil v 1958 F. Criek. Týmto procesom sa hovorí ústredná dogma molekulovej biológie:
- replikácia
- zdvojenie DNA v S fáze
- transkripcia
- prepis genetickej informácie z molekúl DNA do molekúl mRNA
- retrovírusy používajú reverznú transkripciu
- translácia / proteosyntéza
- tvorba bielkovín podľa molekúl mRNA
- preklad genetickej informácie z poradia nukleotidov mRNA do poradia aminokyselín
Replikácia
Replikácia generickej informácie je zdvojenie DNA. Týka sa chromozómov, nukleoidov… Pri replikácii z pôvodnej molekuly vznikajú dve identické kópie. Replikácia prebieha tzv. SEMIKONZERVATÍVNYM spôsobom - obe vlákna materskej molekuly DNA slúžia ako vzor (matrica) pre vytvorenie nových dcérskych vlákien DNA - kópie obsahujú jedno pôvodné a jedno nové vlákno.
![replikácia](f3a7.png)
DNA rozpletie enzým helikáza. DNA sa rozdelí v dve vlákna a DNA-polymeráza ju dokončí na základe princípu komplementarity.
Transkripcia
Pre transkripciu sa používa iba jedno z vlákien DNA. Na špecifickú sekvenciu DNA (TATA box - promotor) sa naviaže enzým RNA-polymeráza, vytvorí sa oko - na princípe komplementarity sa za spotreby energie priraďujú nové nukleotidy.
![transkripcia](2bee.png)
Translácia
Prebieha v ribozómoch v endoplazmatickom retikule. Na transláciu potrebujeme:
- mRNA (ako vzor)
- ribozómy (rRNA + bielkovina)
- dve podjednotky
- väčšia podjednotka
- menšia podjednotka
- podjednotky sa spájajú horečnatými katiónmi
- dve podjednotky
- aminokyseliny (voľne v cytoplazme)
- tRNA (prináša aminokyseliny na ribozómy)
- enzýmy
Proteosyntéza je anabolická reakcia, teda spotrebuje ATP.
mRNA sa číta po trojiciach nukleotidov, ktorá sa nazýva KODÓN. Jeden kodón kóduje jednu aminokyselinu v polypeptidovom reťazci.
![tRNA](3c62.png)
Proteinogénnych aminokyselín je približne 21, čiže existuje 21 rôznych typov tRNA.
Genetický kód
Existuje 64 možných kodónov. Niektoré kodóny kódujú tú istú aminokyselinu.
- mRNA čítame po tripletoch
- genetický kód je degenerovaný - jedna aminokyselina má viac
tripletov/kodónov, čo ju reprezentujú
- leucín - 6 tripletov
- alanín - 4 triplety…
- niektoré triplety nekódujú aminokyseliny
UAA
,UGA
,UAG
= stop (terminačný) kodónAUG
= štart, ale aj kóduje metyonín - na začiatku každej bielkoviny je teda metyonín (niekedy sa neskôr odsekne)
- genetický kód je neprekývajúci - každý nukleotid je súčasťou len jedného kodónu
- genetický kód je univerzálny - platí pre všetky organizmy
Typy génov
- štruktúrne gény
- vonkajší prejav / enzým
- vždy je výsledkom bielkovina
- gény pre RNA
- vytvára sa z nich rRNA a tRNA
- regulačné gény
- ovplyvňujú expresiu ostatných génov
- vytvárajú produkty ktoré blokujú niektoré DNA aby sa nedalo použiť
Genetika prokaryotov
DNA prokaryotov má jeden “prokayrotický chromozóm” - nukleoid. Nukleoid je v prokaryotickej bunke vždy v jednej kópii. Okrem toho sa v prokaryotickej bunke nachádza aj mimojadrová DNA - plazmidy. Plazmidy sú malé kruhové molekuly DNA. Kódujú menej génov ako nukleoid. Plazmidy ponúkajú napríklad schopnosť konjugácie, odolnosť voči antibiotikám, … V plazmidoch sú kódované vlastnosti, ktoré nie sú potrebné pre život bunky, ale ponúkajú rôzne výhody.
DNA prokaryotickej bunky je organizovaná veľmi úsporne - každý jeden nukleoid je súčasťou nejakého génu, narozdiel od eukaryotickej bunky, ktorá má exóny - niečo kódujú a intróny - nič nekódujú.
Prokaryotická DNA je usporiadaná do operónov - transkripčných jednotiek, ktoré obsahujú gény pre enzýmy tej istej metabolickej dráhy. Tieto gény sa prepisujú iba keď je to potrebné - napríklad keď sa v bunke nachádza veľa cukru.
Pri nepohlavnom rozmnožovaní vznikajú vždy bunky geneticky totožné s materskou bunkou. Súbor jedincov vzniknutých delením jednej materskej bunky je klon. Malá variabilita je možná vďaka chybám pri transkripcii.
Genetické dôsledky mitózy a meiózy
Pri mitóze
Ak chceme zistiť, či je genetická informácia bunky vporiadku, chromozómy z buniek izolujeme v metafáze mitózy a zostavíme KARYOTYP - súbor chromozómov z diploidnej bunky zoradený podľa tvaru a veľkosti.
![Typy chromozómov](7c72.png)
IDIOGRAM je zjednodušený zápis chromozómov bunky.
Pri meióze
Pri meióze vnikajú 4 rozdielne dcérske bunky. Pri meióze je vysoká genetická variabilita dcérskych buniek. Dôsledky:
- Rekombinácia hmoty chromozómov v profáze heterotypického delenia
- Redukcia počtu chromozómov
- Segregácia hmoty chromozómov do dcérskych buniek
- Kombinácia chromozómov pri pohlavnom rozmnožovaní
Mendelove Zákony
Boli sformované mendelom (nečakane) okolo roku 1865. Vyjadrujú dedičnosť kvalitatívnych znakov no a ich platnosť si mi overujeme krížením. Kríženie (inak hybridizácia, vzniká hybrid) je párenie dvoch geneticky odlišných jedincov, resp jedincov s odlišným genotypom.
Symbolika
- P - parentálna generácia
- F1 - generácia potomkov (filiálna generácia)
- G - gaméty
- × - symbol kríženia
Kríženie
SPÄTNÉ KRÍŽENIE je kríženie heterozygota s homozygotom, recesívnym, alebo dominantným. TESTOVACIE KRÍŽENIE je kríženie heterozygota s recesívnym homozygotom za vzniku nových plemien:
Príklad
Jeden chovateľ má čierne jazvečíky, druhý chovateľ má hnedé jazvečíky. Obaja tvrdia, že ich jazvečíky sú čistokrvné. Tretí chovateľ sa rozhodol, že ich skríži, Po krížení ale dostal aj hnedé aj čierna jazvečíky.
- B - čierna farba
- b - hnedá farba
P : Bb × bb
G : B, b; b, b
F1 : Bb, Bb, bb, bb
ČISTÁ LÍNIA: potomkovia kríženia dvoch homozygotov
3. Mendelov Zákon
- zákon o voľnej kombinovateľnosti alel z rôznych alelických párov
- polyhybridné kríženie
- 2 znaky - dihybridné
Vzájomným krížením polyhybridov vzniká nejdenotné potomstvo s toľkými kombináciami všetkých alel, koľko je možných kombinácií medzi nezávislými veličinami.
A - čerevné plody
a - žlté plody
B - guľaté plody
b - vajcovité plody
P : AABB × aabb
G : AB, AB, AB, AB; ab, ab, ab, ab
F1 : AaBbAaBbAaBbAaBbAaBbAaBbAaBbAaBbAaBbAaBbAaBbAaBbAaBbAaBbAaBbAaBb
Kombinačný štvorec
G: | AB | Ab | aB | ab |
---|---|---|---|---|
AB | AABB | AABb | AaBB | AaBb |
Ab | AABb | AAbb | AaBb | Aabb |
aB | AaBB | AaBb | aaBB | aaBb |
ab | AaBb | Aabb | aaBb | aabb |
fenotyp: 9AB, 3Ab, 3aB, 1ab
Kravičky
- H - čierna, h - hnedá
- R - rohaté, r - bezrohaté
P : HhRr × HHRr
G : HR, Hr, hR, hr; HR, Hr, HR, Hr
G: | HR | Hr | hR | hr |
---|---|---|---|---|
HR | HHRR | HHRr | HhRR | HhRr |
Hr | HHRr | HHrr | HhRr | Hhrr |
fenotyp: 6HR : 1Hr
genotyp: 1HHRR : 2HHRr : 1HHrr : 2HhRr : 1Hhrr : 1HhRR
Predpoklady mendelových zákonov
- 1 gén = 1 znak
- gény sú na homologických hromozómoch
- Pri polyhybrdizme sú rôzne gény na rôznych chromozómoch
- gény nemôžu byť vo väzbe
Dedičnosť krvných skupín
- Systém KS - A, B, AB, 0
- chromozóm
- 3 alely
- IA, IB - kodominantné alely
- i
- na povrchu červených krviniek sú AGLUTINOGÉNY, ktoré závisia na tom géne
Mimojadrová dedičnosť
- pri prokaryotických bunkách sa ako mimojadrové gény berú gény v plazmidoch
- pri eukaryotických bunkách sa ako mimojadrové gény berú
gény v orgraneloch, ktoré vznikli endosymbioticky
- mtDNA - mitochondriová DNA
- cpDNA - chloroplastová DNA
- malé kruhové úseky DNA
- môžu mať iný význam genetického kódu
- dedia sa vždy po matke, lebo všetko v zygote pochádza z vajíčka
- matroklinická dedičnosť (MATROKLINITA)
U rastlín, znak kódovaný v chloroplastovej DNA, panašovanie rastlín, sa prenáša od matky.
U človeka ide o srdcové choroby, alebo LEBEROVA CHOROBA, ktorá spôsobuje poškodenie zraku.
Dedičnosť a pohlavie
V každej diploidnej bunke sa nachádza pár chromozómov, ktoré nazývame GONOZÓMY, resp. heterochromozómy/nehomologické chromozómy. U človeka máme chromozómy X a Y: Pohlavné chromozómy sa od autozómov odlišujú tvarom, veľkosťou a obsahom. Drvivá väčšina génoch na gonozómoch určuje pohlavie, ale sú tam aj gény s pohlavím nesúvisiace. Aj na autozómoch sa nachádzajú niektoré gény, ktoré určujú sekundárne pohlavné znaky. Mužské gény sú MASKULÍNNE FAKTORY a ženské gény sú FEMINÍNNE FAKTORY.
\/ \/ <- homologický úsek
/\ / <- nehomologický úsek
Na chromozóme Y bolo zatiaľ popísaných 78 génov, väčšina z nich je na tom homologickom úseku - SRY (sex-determining region Y), testes determining region. Tu sa nachádzajú gény na bielkoviny, ktoré podporujú tvorbu testosterónu u embria.
MUŽ -XY - heterogamétne pohlavie
žena -XX - homogamétne pohlavie
O pohlaví dieťaťa sa rozhoduje v momente oplodnenia.
Toto čo sme si tu mi povedali, je cicavčí typ. Typov je viac:
- cicavčí typ (typ drozofila) muž XY
- vtáčí typ (typ abraxas) muž XX
- typ PROTENOR:
- XX = žena
- X0 = muž (z neoplodneného vajíčka)
Dedičnosť viazaná na pohlavie
- dedičnosť viazaná na nehomologické úseky Y (HOLANDRICKÁ dedičnosť)
- dedičnosť viazaná na nehomologický úsek X - choroby hemofília, daltonizmus
- dedičnosť neúplne viazaná na pohlavie - prejav ovplyvňujú pohlavné hormóny
T.H MORGAN krížil drozofily:
- W - červené oči
- w - biele oči
P : XwXw × XWY
G : Xw, Xw; Xw, Y
F1 : XwXw, XwY
Populačná genetika
Populácia je súbor geneticky príbuzných jedincov (ideálne jedného druhu), ktoré žijú na určitom mieste v určitom čase a sú schopné navzájom sa krížť a mať plodné potomstvo.
Typy kríženia v populácii:
PRÍBUZENSKÉ kríženie
- výber partnera na základe prísne vymedzených pravidiel
- inbreeding, incest
- AUTOGAMIA - samooplodnenie
- vzniká veľa homozygotov - vznikajú čisté líinie homozygotov - nízka genetická variabilita, šíria sa genetické choroby, …
NÁHODNÉ kríženie - panmixia
- každý jedinec má rovnakú šancu skrížiť sa s iným
- stále genotypové zloženie
N - celkový počet jedincov v populácii
P - celkový počet dom. homozygotov
H - celkový počet heterozygotov
Q - celkový počet rec. homozygotov
p - frekvencia dom. alely
q - frekvencia rec. alely
$\frac{P}{N} = p^2$ - početnosť dom. hom.
$\frac{H}{N} = 2pq$ - početnosť heterozygotov
$\frac{Q}{N} = q^2$ - početnosť rec. hom.
p2 + 2pq + q2 = 1 (p+q)2 = 1 p + q = 1
- Hardyho-Weinbergov zákon
- V panmiktickej populácii sa genotypové zloženie z generácie na generáciu nemení.
platí za týchto predpokladov:
- populácia musí byť veľká (100+)
- dokonalá panmixia (náhodná)
- všetky jedince sú plodné
neplatí v prípade génoveho driftu - génového posunu:
- mutácie
- migrácia
- selekcia
- V populácii 10000 ľudí je 2500 ľavákov. Koľkí praváci v populácii sú heterozygoti?
q2 = 0.25 q = 0.5 p = 1 − 0.5 = 0.5 2pq = 2 * 0.25 = 0.5 H = 2npq = 5000
- Ak sa v populácii vyskytuje jeden albín na 1000 obyvateľov, aká je frekvencia prenášačov albinizmu?
q2 = 0.001 q = 0.0316 p = 0.9684 2pq = 0.0612
Mutácie
Mutácie sú jednou z príčin dedičnej premenlivosti. Sú to náhodné (a pomerne zriedkavé) zmeny genetickej informácie, ktoré sa môžu prejaviť zmenou znakov a vlastností organizmu. V dôsledku mutácií môžu vznikať nové alely, genotypy, aj fenotypy - môže spôsobiť vznik nových druhov. Mutácie ktoré sa neprejavia vo fenotype nazývame neutrálne. Buď to vyrieši degenerovanoť genetického kódu, alebo sa uplatnia reparačné mechanizmy. Niektoré mutácie sú zas letálne - smrteľné.
Vlastnosti mutácii
Mutácie sú náhle, neusmernené, dedičné. Faktory, ktoré spôsobujú mutácie sú mutagény - môžu byť:
- fyzikálne - svetlo a iné žiarenia
- chemické - pesticídy, kyselina dusitá, modifikované dusíkaté bázy, halogénové rozpúšťadlá, benzén
- biologické - onkovírusy
Proti mutagénom pôsobia napríklad antimutagény, ako antioxidanty.
Klasifikácia mutácií
- podľa spôsobu vzniku - spontánne, indukované
- podľa typu zasiahnutej bunky - somatické - telové bunky, gametické - gaméty (závažnejšie, dedičné)
- podľa rozsahu - génové, chromozómové, genómové
Génové mutácie
- bodové mutácie:
- zámena nukleotidu
- často sa dajú obísť degenerovanosťou genetického kódu.
- posunové mutácie
- insercia/delécia
- príklady:
- ALBINIZMUS
- FENYLKETONÚRIA - neschopnosť spracovať fenylalanín
- GALAKTOZÉMIA - neschopnosť tráviť galaktózu
- CELIAKIA - lepok
- KOSÁČIKOVÁ ANÉMIA - kosáčikové červené krvinky DEDIČNÉ ENZÝMOVÉ PORUCHY
Chromozómové mutácie
Podmienkou pre vznik ch. mutácií je vznik zlomu na chromozóme.
- delécia
- duplikácia
- inverzia
- translokácia
Genómové mutácie
Zmena počtu chromozómov, alebo celých sád.
- Euploidná bunka je taká, ktorá má správny počet jednotlivých chromozómov.
- Haploidia je keď sú somatické bunky haploidné (napr. pri partenogenéze).
- Polyploidia je znásobenie počtu chromozómových sád
v telovej bunke.
- u živočíchov je zriedkavejšia ako u rastlín
- môže to byť dobré
- 3n jablone, hrušky
- 6n černice
- 8n vinič
- Aneuploidia je zmena počtu chromozómov, nie celých
sád
- 2n+1 = trizomia
- 2n-1 = monozomia
- 2n-2 = nulizomia
- choroby
- trizómia 21. chromozómu - Downov syndróm
- ďaleko odsadené oči, nízke čelo, mentálna retardácia
- trizómia 18. chromozómu - Edwardsov syndróm
- srdcové poruchy, dýchavičnosť, nižší vzrast
- trizómia 21. chromozómu - Downov syndróm
- zmeny počtu gonozómov
- monozómia X - turnerov syndróm
- chýba baarovo teliesko
- fenotypovo žena, zakrpatené pohlavné orgány, oslabené mentálne funkcie
- trizómia XXY - klinefelterov syndróm
- zakrpatené pohlavné žľazy
- XYY - supermuž
- problémy so sústredením, agresia, …
- XXX (možno ešte ďalšie X) - superžena
- viac baarovych teliesokesokesokesok
- monozómia X - turnerov syndróm
Autozómovo dominantná dedičnosť
Chorobu podmieňuje dominantná alela.
- Polydaktýlia - mnohoprstosť
- Brachydaktýlia - krátkoprstosť
Príklad:
Brach muž s otcom Brachom a zdravou materou sa oženil so zdravou ženou.
rodičia: Bb × bb deti: Bb, Bb, bb, bb
Genetika Človeka
skúma dedičnosť normálnych aj nenormálnych ľudských znakov
u človeka nemôžeme selektovať, neobmedzene krížiť, …
klinická genetika
- riešenie a dignostika klinických chorôb
cytogenetika
molekulová genetika
Metódy výskumu
- Rodokmeňová analýza
- Gemelológia - výskum dvojčiat
- Populačný výskum
- Výskum chromozómov
- cytogenetická metóda
- robí sa karyotyp
- odhalia sa všeky genómové mutácie
- Prenatálna diagnostika
- výskum plodovej vody
- Postnatálna diagnostika (no way to by som nečakal že keď je prenatálna tak bude aj postnatálna)
Dedičné choroby a dispozície
- dispozícia sa nemusí prejaviť (akože prečo sme týmto strávili celú hodinu veď je to jasné)
Prevencia:
- eugenická
- vyhnúť sa chorobe
- eufenická
- liečiť chorobu
fenotyp bombay - krvná skupina 0 aj keď rodičia majú AB - genetický trolling